I’m a postgraduate student of Shanghai Jiao Tong University. At present, I mainly engaged in NGS data integration analysis and bioinformatics analysis tool development.

这是李剑峰的个人主页。目前在上海交通大学医学院附属瑞金医院,医学基因组学国家重点实验室,上海血液学研究所进行研究生阶段的学习,主要研究方向是生物信息学和白血病。希望能通过这个博客分享一些有趣的事、有趣的人,并整理出一些在攻读博士学位时学到的一些知识(保密部分除外)。主要涉及的内容可能包括人物介绍、日常思考、白血病相关的知识(如白血病发病分子机制、分子分型及其治疗)、生物信息学(如机器学习算法及其应用、软件开发及其技巧、高通量测序数据分析)。

2018年9月我开始将博客中与生物信息学相关的文章同步至我建立的知乎专栏:Bioinformatics

下面列出了一些我参与或负责的一些公开项目。



项目 简介
BioInstaller 一个用于创建交互式、可重现的生物数据分析应用的综合类R包
ngstk 二代测序数据分析工具箱,主要开发方向为数据质量控制、数据格式转换、数据可视化及其颜色主题
ngsjs 一个专注于整合、开发高通量测序数据分析命令行工具、工作流程、交互式Web组件的项目。
annovarR 用于生物信息学数据注释的框架
iseq 基于基因Panel测序数据的整合分析方法
configr 用于R语言读取配置文件的R包
wQAP 基于Galaxy的病毒准种数据云分析平台
BioRes 收集生物信息学相关学习资源的开源项目

路漫漫其修远兮,吾将上下而求索。——屈原